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市场产品鱼龙混杂
近年来，虽然我国在乳制品用乳酸菌、益生菌菌种和制剂研发应用上取得可喜突破，但由于研发起步晚，与乳业发达国家相比，我国的研发应用水平仍然存在很大差距，主要是自主鉴定的菌种种类少、生产制剂的技术积累薄弱、产业化应用规模小，难以适应我国乳制品产业产品升级提档的要求。
相关专家表示，生产乳制品用的菌剂，需要将不同的菌种按照科学比例进行配比，这对自主掌握的菌种数量和技术工艺的要求高，国外研发早，技术和知识产权积累雄厚，丹尼斯克等国外龙头企业在该领域优势明显，我国在短期内突破难度大，目前发酵剂的进口比例高达90%-95%。
此外，当前市场上缺乏行业标准，鱼龙混杂。为迎合人们对健康的关注，市场上不少产品蹭热度、贴概念，进行夸大或虚假宣传。以益生菌为例，据天眼查的数据，目前我国有3000多家打益生菌概念的生产加工企业，其中45%的企业成立于5年内。由于国内对于益生菌缺乏国家和行业标准，目前很多菌株在没有临床数据支撑下，就被一些企业趁着风口投入市场，导致行业内产品质量参差不齐，功效也难以印证。
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提升研发水平 出台制订标准
针对我国乳酸菌、益生菌及相关菌剂研发应用面临的难题瓶颈，业内专家和企业人士建议将乳制品用乳酸菌、益生菌菌种和制剂研究确定为我国乳制品产业升级的基础性和重点突破方向之一，设立重点专项，牵引研发水平提升。
专家们认为，当前我国在乳酸菌、益生菌菌种和制剂研究上，研发基础弱，建议进一步加大研究投入力度，设立国家级重点研发专项，带动整体研发水平提升。
此外，要尽快制定国家标准，规范市场。目前益生菌既没有出台国家标准也没有行业标准，导致市场上出现“劣币驱逐良币”的现象，建议尽快制定国家标准和行业标准，加强知识产权保护力度，从菌种的安全和质量方面提高相关产品准入门槛。