肉苁蓉和管花肉苁蓉现属国家二级保护植物。由于寄生植物自然繁殖能力较弱，野生肉苁蓉资源已濒于枯竭，依《濒危野生动植物种国际贸易公约》（2019版）也将列当科肉苁蓉Cistanchedeserticola列入濒危植物，即野生荒漠肉苁蓉不能像其他普通中药材一样进出口。
现在，肉苁蓉人工种植技术已经很成熟了，市场上销售的肉苁蓉几乎都来自人工种植。
人工种植的肉苁蓉和野生肉苁蓉的功效一样吗？
肉苁蓉是一种寄生植物，寄主主要为梭梭和红柳，从梭梭寄主中吸取养分及水分。因此，种植肉苁蓉必先种其寄主梭梭或红柳。以梭梭为例，只有栽种3年以上的梭梭树才适合于嫁接肉苁蓉，而肉苁蓉嫁接完成到采收的时间一般也需要3年以上。
人工栽培肉苁蓉与普通的人工种植蔬菜可大不一样，人工种植的肉苁蓉都是在野生环境生长，比起纯野生肉苁蓉而言，有人工进行干预虫害，生长环境所需的营养物质等。因此，人工种植的肉苁蓉不仅跟野生肉苁蓉的功效一样，甚至更好。
对于肉苁蓉的研究在20世纪80年代就已经开始，我国的肉苁蓉人工栽培技术成熟，在内蒙、新疆、甘肃等地，人工种植肉苁蓉已实现了的经济支付，生态改善，同时也延续了肉苁蓉2000多年的中药传承。