以色列方面指责伊朗在叙利亚的军事存在威胁其国家安全，其中一个重要理由，就是以色列不断向叙利亚输送高技术武器，包括弹道导弹、巡航导弹、远程火箭弹和无人机等，甚至还在叙利亚建设了多个导弹组装工厂，但根据公开报道看，伊朗方面并未从叙利亚境内向以色列发射导弹或无人机，仅曾炮击过戈兰高地上的以军，倒是叙利亚防空部队在发射S-200防空导弹攻击以色列战机的时候，被以色列发射的防空导弹击落，S-200导弹的残骸落到了以色列境内。
以色列方面还指责，伊朗通过叙利亚做中转，将大批武器提供给黎巴嫩真主党武装等代理人，以色列方面以此为借口，不断空袭叙利亚境内的伊朗武装基地、军火库和导弹工厂，叙利亚境内的伊朗武装承受了以色列空袭的大部分火力，相比之下，以色列空军对叙利亚境内真主党武装的空袭力度并不频繁。
近日，以色列商业卫星公司再次公布了多幅卫星照片，显示叙利亚北部阿勒颇附近的萨菲拉导弹工厂在空袭后遭到了重创，9月11日，这里的伊朗导弹工厂再次遭到以色列空军空袭，以色列方面的消息显示，萨菲拉的工厂主要是为真主党组装导弹，工厂的两栋主要建筑遭到了破坏性攻击，其中一栋建筑很可能因为内部储存的炸药殉爆而被夷为平地。
以色列情报部门声称，近期对叙利亚境内伊朗导弹工厂的空袭，主要是为了减缓其生产速度，按照以色列方面的说法，伊朗通过叙利亚向黎巴嫩真主党提供了大量高技术武器，这也是真主党头目哈桑·纳斯鲁拉宣称该组织拥有数万枚导弹的原因（很可能将火箭弹也算进来了），不过，真主党武装近年来主要在叙利亚境内，作为伊朗武装的一部分帮助叙利亚政府军作战，几乎从未有任何公开报道显示其跟以色列方面有过直接军事冲突，这一点跟巴勒斯坦哈马斯、杰哈德完全不同：后者不时向以色列居民区发射大量火箭弹，随后又在以色列的猛烈空袭下主动停火。
问题来了，真主党武装从伊朗方面接收的大量导弹去了哪儿？推测很可能是作为战略储备隐藏在秘密军火库，但真主党武装与德黑兰之间并非绝对的隶属关系，真主党方面一直试图提高其独立性，摆脱德黑兰的空袭，甚至为此遭到过伊朗革命卫队圣城旅前指挥官苏莱曼尼的打压，伊朗方面交给真主党的军火，很可能并没有那么多，大部分运抵叙利亚以及在叙利亚制造的军火，很可能都毁于以色列空袭。
