《杀手3》在发售当天由于大量玩家涌入服务器，导致了服务器宕机。目前游戏仍连不到服务器上，显然开发商IO Interactive对玩家们的强烈热情并没有准备。
目前IO Interactive已经做出了回复：“我们已经开始着手修复该问题。我们知道每个玩家都想马上玩到游戏。我们正在努力，尽快让每个玩家都玩上游戏。”
上面的声明还提到了继承存档的问题：玩家在《杀手3》中的游戏进度会在导入前作存档中时消失，所以很多系列玩家都选择在继承存档后再正式开始游戏。因此现在由于服务器宕机而选择离线游玩的一部分玩家就位于一个尴尬境地：在服务器恢复后并继承存档时，此前的离线游玩进度将会消失。
甚至IO Interactive也建议玩家等到完成存档进程后再开始游戏：“如果你已经开始游玩《杀手3》，然后选择了继承存档，那么到存档完成之时，你将失去在《杀手3》中获得的所有游戏进度。我们建议有意选择继承存档的玩家在开始游玩前耐心等待服务器修复。”