梦幻西游互通版本质是pc端梦幻西游的移动端延伸产品，核心数据和端游完全互通，玩家在端游创建的角色、拥有的装备召唤兽、积累的游戏资源都可以直接在互通版使用，定位是满足端游老玩家随时随地登录游戏的需求，并没有脱离端游的核心框架，相当于把pc端梦幻装进了口袋。而梦幻西游手游版是网易针对移动端用户单独开发的全新游戏，数据和端游、互通版完全不互通，从底层规则到内容设计都是重新搭建的，定位是面向移动端轻量化用户的mmorpg，核心目标是适配手机用户碎片化的游戏习惯。
收费模式与经济体系差异
互通版沿用了端游的点卡计时收费模式，玩家在线就会扣除对应点数，经济系统也和端游完全打通，支持全物品自由交易，物价完全由市场供需决定，玩家可以通过游戏内产出获得稳定的收益，和端游的经济生态完全一致。而梦幻西游手游采用道具收费模式，不需要点卡就能免费游玩，为了控制经济平衡限制了自由交易，绝大多数游戏道具无法直接玩家间交易，仅开放了少数珍品装备召唤兽的交易渠道，且有严格的价格限制，盈利逻辑主要靠售卖外观、养成道具来实现。
玩法养成与体验适配不同
互通版完整继承了端游复杂的养成体系，从门派经脉、装备熔炼到召唤兽炼妖打书，所有端游的玩法都完整保留，养成周期长，玩法深度足够，端游老玩家可以无缝衔接。但因为是端游移植，操作逻辑更贴近pc，复杂功能多，对纯新手玩家门槛较高。手游版针对移动端做了轻量化调整，简化了很多复杂的养成规则，降低了新手入门门槛，操作界面专门为触摸屏优化，自动战斗、一键任务功能更完善，更适合玩家利用零散十多分钟的休闲时间游玩，养成节奏也更平缓，适配轻度用户的娱乐需求，两类产品对应了完全不同的玩家群体，老端游玩家更偏好互通版，喜欢轻量休闲的新用户更适合手游版。